RAPTOR

Beschreiwung

RAPTOR ass eng innovativ Software fir präzis Protein Struktur Viraussetzung entwéckelt. Et kombinéiert fortgeschratt Analyse Tools an enger integréierter Software Léisung a bitt dräi verschidde Threading Methoden. D'RAPTOR eenzegaarteg Integratiounsprogramméierung ass ganz effektiv fir Struktur Templates vun Ziler mat niddereger Sequenzhomologie ze fannen an ass fäeg qualitativ héichwäerteg Modeller ze generéieren. Déi einfach ze benotzen Interface an einfach ze verstoen E Wäerter sinn ideal fir Ufänger an Experten. Virun allem den intuitiven Display vun der Ausgab erméiglecht de Benotzer d'Resultater einfach op ee Bléck ze verstoen. Gitt eng Zilproteinsekvens, wann et en homologe Protein mat bekannter 3D Struktur ass, kann et fonnt ginn andeems Dir Sequenzuchsinstrumenter wéi PSI-BLAST benotzt, och an RAPTOR geliwwert. D'Struktur vum Zil gëtt dann aus der bekannter Struktur gebaut; awer, wann d'Sequenzhomologie net bedeitend ass, also manner wéi 25%, kann PSI-BLAST net mat engem zouversiichtlechen Hit kommen. Am Géigesaz zu PSI-BLAST, déi einfach eng Sequenzsich mécht, Protein Threading, Fold Unerkennung, benotzt souwuel Homologie wéi och Strukturinformatioun. Et scannt d'Proteinsekvens mat enger onbekannter Struktur géint eng Datebank vu bekannte Strukturen. Duerch eng Scorefunktioun an d'Kompatibilitéitsanalyse tëscht dreidimensionalen Strukturen a lineare Proteinsekvensen ze maachen, gëtt déi bescht strukturell Schabloun identifizéiert aus deem se d'Sequenzestruktur bauen. Als Resultat gëtt Protein Fuedem eng besser Viraussiicht wéi Homologie Modeller wann et marginal Sequenz Homologie ass.